Yayasan Kemitraan Indonesia Sehat (YKIS) adalah sebuah organisasi nirlaba yang berupaya mendorong kegiatan dan memberdayakan organisasi kemasyarakatan dalam upaya promotif dan preventif dalam kesehatan masyarakat, mendukung kegiatan penelitian dan publikasi ilmiah serta melakukan upaya-upaya advokasi untuk mengatasi permasalahan kesehatan masyarakat di Indonesia.

YKIS didirikan di Jakarta pada tanggal 22 Desember 2017 oleh Dr. Nafsiah Mboi, SpA, MPH; Prof. Dr. Samsuridjal Djauzi, SpPD, KAI; dan Prof. Dr. Zubairi Djoerban, SpPD, KHOM berdasarkan Surat Keputusan Menteri Hukum dan Hak Asasi Manusia Republik Indonesia Nomor AHU-0019035.AH.01.04.Tahun 2017.

Yayasan ini didirikan atas dasar kepedulian dan komitmen untuk menggalang sumber daya, dana dan pengalaman dalam menanggulangi permasalahan kesehatan masyarakat, khususnya HIV-AIDS. YKIS berfokus membangun upaya kemitraan dalam peningkatan kemampuan dan peran organisasi kemasyarakatan di bidang preventif dan promotif.

Dalam struktur Badan Pengawas dan Badan Pengurus YKIS, terdapat para praktisi senior kesehatan masyarakat yang pernah menjadi tulang punggung keberhasilan menyelenggarakan Konferensi Internasional AIDS se-Asia Pasifik ke-9 di Bali tahun 2009.